瘀毒阻滞证肝癌(含肝)组织N-ras基因转录水平的变化(一)
——异硫氰酸胍一步法制备不同肝组织的总RNA
方肇勤
(2000-11-1)
临床研究表明,瘀毒阻滞证是原发性肝癌的基本病机。肝癌的发生,往往建立在长期、反复的肝胆湿热基础上,反复的肝脏炎症损伤基础上,日久形成瘀毒阻滞病机。已有的研究表明,瘀毒阻滞证的肝组织中,部分与癌证发生有关的基因转录与表达的水平会发生异常。食入二乙基亚硝胺(DEN)会引起肝炎,长期食入会诱发大鼠肝癌,其病理演变与人类肝癌发生的病理相似。因此,本实验采用DEN诱发大鼠肝癌,分设模型组和正常对照组,模型组自由饮用DEN水溶液,浓度为80mg/L,造模24周后处死大鼠,分别切取出肝(模型组含肝癌)组织,用于制备RNA。
制备纯净且完整的RNA对于许多分子生物学实验至关重要。RNA主要由rRNA(占总量的80-85%),tRNA和核内小分子RNA(占总量的10-15%)以及mRNA(占总量的1-5%)所构成。RNA的制备方法有多种,本实验采用制备总RNA一步法。
一、原理
本方法采用强RNA酶抑制剂异硫氰酸胍等,抑制RNA的降解,并使RNA与蛋白质分离进入溶液,离心后,RNA选择性地进入无DNA和蛋白质的水相,之后被异丙醇沉淀。提取的RNA可用于Northern blot和过Oligo dT柱。
二、实验准备
1.器材
实验台、剪刀、镊子
电子天平、称量膜
可调移液器P1000、P200、P20及其经消毒的盒装蓝、黄吸头
经消毒的1.5ml Eppendorf管、10ml离心管、试管架及其水浴用试管架
定时器、记号笔、一次性手套和筒纸
4℃、-20℃和-70℃冰箱
JB50-D型匀浆器(含玻璃匀浆管及杵)
冷冻1.4万转台式离心机
真空离心干燥器、真空泵
分光光度计、石英比色杯
双蒸水、冲洗瓶
2.试剂
D溶液:
异硫氰酸胍250 g
去离子水293 ml
0.75 mol 柠檬酸钠(pH 7)17.6 ml
10%十二烷基肌氨酸钠26.4 ml
以上为贮藏液,室温下可保存三个月。使用前加:
0.36 ml β-巯基乙醇→50 ml 上液,即为D溶液。
水饱和酚(4℃)
氯仿:异戊醇(49:1)
75%预冷乙醇
高压消毒过的去离子水
2M醋酸钠(pH 4)
异丙醇
3.实验材料
肝癌模型大鼠和正常同龄大鼠肝脏各一只
碎冰及其保温容器
三、实验步骤
布置实验环境,试管编号。
分别断头处死大鼠,剖腹切取各大鼠肝脏(含肝癌)组织,称取50 mg,冰上剪碎。
分别把剪碎的肝脏组织移入匀浆管,加入:
500 ulD溶液
室温下匀浆(9档,1分钟),把匀浆液移入1.5ml管,分别依次加入:
50 ul 2mol 醋酸钠(pH4)
500 ul 水饱和酚
100 ul 氯仿:异戊醇(49:1)
充分颠倒混匀 10 s.,置于冰上 15 min.;
离心10,000 g 20 min.于4℃,移上清入一新1.5ml管,加入:
500 ul 水饱和酚
100 ul 氯仿:异戊醇(49:1)
充分颠倒混匀 10 s.,置于冰上 15 min.;
离心10,000 g 20 min.于4℃,移上清入一新1.5ml管,加入:
500 ul 异丙醇(-20℃预冷)
颠倒混匀,-20℃放置 1 hour,离心10,000 g 20 min.于4℃,去水相,加入:
150 ul D溶液,指拨溶解沉淀,加入:
150 ul 异丙醇(-20℃预冷)
指拨混匀,-20℃放置1 hour,离心10,000 g 20 min.于4℃,去水相,加入:
500 ul75%乙醇(-4℃预冷)
离心10,000 g 10 min.于4℃,去乙醇,真空离心干燥 15 min.,加入:
25 ul 经高压消毒过的去离子水,于冰上溶解RNA。保存于-70℃冰箱。
紫外分光光度计测定RNA的含量:
取样本5ul加入石英比色杯内,加入双蒸水0.8ml,充分混匀。与双蒸水对照。读260nm、280nm两个测得值,记录。计算:
260nmOD为1时,为40ug RNA,因此计算如下:
260nmOD×160×40
样本RNA含量(ug/ul)=─────────
1000
当OD值260/280<1.8时,提示有蛋白或酚的污染。
四、实验结果
分光光度计读数 260/280 值约为 1.85±0.04。
五、注意事项
1.鉴于肝癌组织质地的不均匀性,或为纯癌肿,或为血肿,或以异常增生的肝组织为主,同一肝组织所取材的不同,其结果便会不同。因此,为避免取材上的误差,可以切取较大的肝组织,以便包含不同质地的肝组织,使各组的取样误差减到最小。
2.实际研究时,作为小样本,同一组通常要求10只以上大鼠,各取一块肝组织,以减少误差。由于肝组织量增多,所有试剂均须按比例放大。
3.由于RNA酶到处存在,不易失活,极易造成污染而导致RNA的降解,使整个工作功败垂成。因此建议所有用品均应严格按要求消毒,注明RNA专用。严格按无菌操作要求操作。抽提过程中,由于异硫氰酸胍是RNA酶的强抑制剂,因此在整个实验过程中不会产生RNA的降解。但在最后一步,RNA干燥和加水溶解时特别要防止RNA酶的污染。
4.在吸取上清时,切不可将上清与酚交界处的蛋白及下面的酚吸起,造成RNA的污染。因此,通常轻轻吸取上清,且留有部分上清,以免搅起紧邻着的酚。
5.若需抽提大量RNA时,以上试剂、试管可按比例放大。所获RNA建议分装,以免使用过程中污染、降解。
参考文献
1.Piotr Chomczynski and Nicoletta Sacchi. Single-step Method of RNA Ioolation by Acid GuanidiniumThiocyanate-Phenol-Chloroform Extraction.AnalyticalBiochemistry 1987,162, 156-159
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