经过本科优秀学校评估后，在原有基础上对中医内科教学的工作又进行了深入的改革：在教学中突出中医内科学的桥梁课程地位，将学生临床辨证思维的建立作为该课程教学的重点，组织编写了《中医内科学》、《中医内科临床辨证思维》等系列教材；在教学方法上开展案例为中心的教授方式，并在中医内科学教学中尝试 PBL 教学法；在实践教学中将中医内科学实践作为小学期“早临床、多临床”的主要抓手，并开发了《中医内科学临床病例实践程序考核》等多媒体课件，丰富了实践教学内容。该多媒体考核软件经近五届学生约 500 人次的使用，普遍反映在提高临床辨证思维及中西医双重诊治能力方面有较大帮助，同时得到了教育部评审专家的一致好评，希望尽快充实完善后推广运用。
    通过近 3 年的改革实践，学生对课堂教学的评价达到学校 A 级教学质量水平，主讲教师多次被评为“我心目中的好老师称号”和学校优秀教师一等奖。学校每二年组织一次课堂教学比赛，由各学院专家对课程进行评价，中医内科学主讲教师的比赛成绩名列各临床课程前茅，并获得多次学校教学成果奖。两位课程负责人均被列为中医临床教学主持人和示范教学主持人。

    上海中医药大学借鉴传统师承模式，利用产学结合模式在医学院校中率先实行 “ 三学期制 ” ，设实践性质小学期，以按中医基础技能、预防和社区医学、中医内科学初步临床实践等内容每年递进，实现“早临床、多临床”理念。同时我校利用产学结合模式成立了 “ 上海市中医机构医、教、研联合体 ” ，建立了 “ 双导师 ” 的实践指导体系。目前联合体医院已增加到 40 余家，同时还与 WHO 上海嘉定初级卫生保健中心等单位共建预防医学教学基地，这对附属医院的临床教学起了很好的补充。