马绍尧教授跟随著名中医外科学家顾伯华教授抄方和临证长达20年，故马氏临床特色颇有顾氏影响的痕迹。其结合现代皮肤病学和自己四十多年的临床实践，进一步探索中医皮肤病发病机制和特点，归纳总结出了具有鲜明特色的以传统中医脏腑学说为核心的诊治经验：皮肤病，尤其疑难性皮肤病大多从风湿热和虫毒论治，而归纳病因病机主要以火毒为主，燔灼营血、内侵脏腑，而以心火、肝郁、肾虚为常见，辨证施治，常规多以清热解毒、养阴清热、活血化瘀、补益肝肾等为法。

    皮肤病临床，从脏腑学说辨证分型。认为湿疹乃禀赋不耐，风湿热邪客于肌肤所致，或因脾胃虚弱，运化失调，素质遗传，以及各种致敏物质和毒素侵袭而成。以清热利湿方为主随证加减，治疗各种湿疹，获得较好有效率，湿疹专科成为上海中医药大学A级专科，该方卫生局立为新药临床研究课题。银屑病从肝论治，分型为血热证、血瘀证，分别采用凉血解毒、活血化瘀解毒法治疗，随证加减，取得较高的临床疗效。并从有效方剂中筛选出有效的内服药和外用药，从而提高疗效。如解毒化瘀汤经临床及动物试验，均证实其临床有效。慢性皮肤病如脱发、痤疮、皮炎，由内脏损害致病者，多表现为阴虚火旺症候。如痤疮从肾论治，以养阴清热方治疗；各种皮肤“疣”、“疱疹”，从肺论治，以清热解毒方治疗，均取得较好疗效。

    临证用药因时、因地、因人、因病、因证、因型、因阶段、因缓急而变，灵活加减。治疗顽固性皮肤病如银屑病等注意顾护胃气。用药剂量以轻巧为重，“平治于权衡”，对于有副作用的药物尤其谨慎，中病即止，毋使过之，毋使伤正，并注意食物果素食养之。